Die NFDI4Chem-Suche: Forschungsdaten in der Chemie gezielt suchen und finden
Sie sind auf der Suche nach Spektren (NMR, IR, UV/VIS, MS usw.) von chemischen Verbindungen oder anderen Daten im Chemiekontext und sind es leid, dafür verschiedene Datenrepositorien aufwendig einzeln zu durchsuchen? Dann ist die zentrale NFDI4Chem-Suche genau das Richtige für Sie! Die TIB entwickelt im Rahmen der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur für das Fach Chemie (NFDI4Chem) diesen Suchdienst als zentralen Einstiegspunkt für eine übergreifende Suche in den verschiedenen Chemie- und chemienahen Repositorien der NFDI4Chem-Föderation. Damit leistet die TIB einen wichtigen Beitrag zur Etablierung einer FAIRen Forschungsdateninfrastruktur in der Chemie, indem insbesondere die Auffindbarkeit (F für Findable in FAIR) von Daten verbessert wird. Der Suchdienst sammelt Metadaten von derzeit mehr als 90.000 Datensätzen aus den Chemie-Repositorien Chemotion, MassBank, RADAR4Chem, sowie bald auch nmrXiv, und indexiert diese für eine übergreifende Suche. Regelmäßige Updates des Index stellen sicher, dass die Suche stets aktuelle Ergebnisse liefert.
Viele Repositorien stellen Datensätze von bestimmten Messmethoden bereit. So enthält MassBank Datensätze von massenspektroskopischen Messungen. Mit der NFDI4Chem-Suche können nun Datensätze unterschiedlicher Messmethoden zu einer bestimmten chemischen Verbindung mit nur einer Suchanfrage über alle indexierten Repositorien gefunden werden. Verschiedene Filter erlauben dann eine Eingrenzung der gefundenen Datensätze nach Kriterien wie etwa dem Ursprungsrepositorium, der Messmethode oder Lizenz. Mit der erweiterten Suche kann darüber hinaus anhand von chemischen Struktur-Identifikatoren wie InChI, InChI Key oder SMILES auch gezielt nach molekularen Strukturen gesucht werden. Die Suche verlinkt auf die Originaldatensätze in den Repositorien, die in vielen Fällen detaillierte Visualisierung und Analysewerkzeuge bereitstellen.
Mit der Einbindung von Chemie-Datensätzen aus eher generischer Repositorien wird der indexierte Suchraum in weiteren Schritten sukzessive vergrößert. Als erstes generisches Forschungsdatenrepositorium wird DaRUS der Universität Stuttgart angebunden.
Neben der technischen Anbindung von Chemie-Repostorien arbeiten NFDI4Chem und TIB gemeinsam mit der IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) an der Harmonisierung der verwendeten Metadatenformate und einer Erweiterung von Metadatenstandards um chemiespezifische Datenelemente. Insbesondere die Einbindung von Metadaten zur Beschreibung von chemischen Verbindungen, Moleküldaten und chemischen Strukturen führt zu Verbesserungen der Benutzeroberfläche mit Möglichkeiten der Implementierung einer chemischen Struktursuche, welche das Zeichnen von molekularen Strukturen als Sucheingabe erlaubt.
Haben wir Ihr Interesse geweckt? Dann probieren Sie die NFDI4Chem-Suche am besten doch gleich selbst aus. Fragen, Anregungen oder Verbesserungsvorschläge zum Suchdienst nimmt der NFDI4Chem Helpdesk (helpdesk@nfdi4chem.de) jederzeit gerne entgegen. Wir freuen uns auf Ihr Feedback!
... leitet das Lab Linked Scientific Knowledge und beschäftigt sich mit Wissens- und Forschungsdaten-Management und der Entwicklung und Anwendung von Ontologien.
Er ist zusammen mit Prof. Christoph Steinbeck, Universität Jena Sprecher des Chemiekonsortiums der NFDI4Chem in der Nationalen Forschungsdaten Infrastruktur.
works as Research associate in the field of research data management (RDM) within the NFDI4Chem project (Task Area 6 - Synergies) at TIB - Leibniz Information Center for Science and Technology in Hannover, Germany.
